目前竹鼠没有专门的疾病疫苗，这也是竹鼠等特种养殖区别于鸡鸭鹅等传统养殖的地方。预防疾病主要食物的饲喂。夏季喂西瓜皮、地桃花、茅草根、绿豆等清凉消暑饲料，冬春季节喂鸭脚木、猫抓刺、马甲子等止痛退热防感冒的青饲。平时多喂嫩竹枝、竹叶、竹竿，在精料中注意添加骨粉、EM菌。
首先是温度，竹鼠相对怕高温不怕低温，经常有鼠友反映夏天运输中暑死亡，因此很多人不敢夏天引种，其实运输中暑死亡的都有一个共同点，闷热，关键是个闷字， 一闷必死，放铁笼的空间不能太小，层数不能太高太密，要保证绝对的空气对流，就是说车子运行中要打开窗，有空调当然要开空调，但有些车空调不是万能的，有可能前排冷，尾部热，车子长时间运行也会产生热量，如果笼子太密，层数又高，底部的鼠非常容易闷死，这也是多数人运输死亡的原因。
首先你要注意观察，看看有没有弓背的精神不好的竹鼠总是在角落睡觉，不吃不动，眼流白色液体，坚持不了几天就死了；有没有个别竹鼠前半天还好好的，后半天就死亡了，死亡时吃食，拉屎都很正常，也就是我们说的无缘无故，突然死亡！；检查竹鼠的粪便，有没有带血丝的，拉血痢的，所谓血痢就是肛门大量的拉血；有没有拉稀喂药不见好转，越发严重，转而果冻状带血的。
可选择百毒消，或者大火对鼠池消毒。
1、竹鼠难产造成小鼠一生下来就死亡。2、竹鼠幼仔死胎和假死现象。3、竹鼠幼仔营养不良造成的死亡。4、母竹鼠吃仔。
球虫病感染，潜伏期内无任何征兆一旦进入发病期，一般一天之内死亡。首先是迟钝不吃东西，最后的几个小时内，四肢慢慢伸直僵硬，头部后仰最后死亡。不同体质的鼠死亡速度大不相同，有些可能一两天慢慢死掉期间还会出现类似肠炎的症状，而有些几个小时内就死掉无任何征兆。
竹鼠40-50日龄后断奶分窝，分窝分工2-3批，每隔3-5天分1批，仔鼠成活率在98％以上。
可以，蒙脱石散加泻立停或喂蒙脱石散后两小时喂诺氟沙星加黄连素。补充生理盐水、葡萄糖溶液。少精料多粗料，环境食物方面做好改善。
腹胀腹部胀，提鼠手接触腹部有明显的波浪感，大粪便有腥臭味，不成形，精神萎靡不振，脱水背躬，尾部毛湿漉，采食量下降，甚至不进食，之后腹泻不止，严重脱水。解剖可发现腹腔积水呈现白色透明胶状，肠道黏膜正常，肝脏，肺部无明显坏死灶。
竹鼠池漏粪口的尺寸没有标准，但是大多数对于60*60*60的池子，漏粪口大小为长15~20公分，宽为2公分左右。1M以上的大池，漏粪口尺寸为长40CM左右宽2CM。2公分的宽度是经过多个养殖户经过多年的养殖经验得出的一个比较综合的尺寸。