竹鼠肠炎是由细菌、病毒、寄生虫等引起的肠道疾病，消毒是预防和控制该病的重要措施之一。可以使用含氯消毒剂、过氧化氢、紫外线等消毒剂进行消毒。此外，加强竹鼠饲养管理，严格执行科学的饲养管理制度，饲料应新鲜多样化，不喂带水或霉烂食物，规范技术操作，特别是疾病流行季节杜绝其他外来人员人场，也是预防竹鼠肠炎的重要措施之一。
竹鼠既怕冷又怕热，在低于5℃时行动减少，交配次数减少。低温对刚出生鼠仔伤害较大，不小心掉出窝母鼠没及时叼回去就容易冻僵。高于30℃，食欲下降，性情暴躁合群容易打架。公鼠交配次数减少，母鼠受孕率下降。高于34℃在通风不良的状态下竹鼠容易中暑。
向小的个体户购买种鼠时，如果是同窝的，不要直接配对配组，要另外再买其他户的种苗回来合群饲养，交叉搭配，有利繁殖。大的养殖场，不同窝的仔鼠断奶时放到大池合群饲养，合群后交叉组配再出售。如果养殖户自繁自养，饲养数量少，则繁殖后代需要与别的养殖户交换公鼠或母鼠，才能有效防止近亲繁殖。
石灰给竹鼠池消毒也是养殖户常见的消毒方法，配制石灰乳取1公斤生石灰加1升水消和(指生石灰加水，形成熟石灰的操作过程)形成熟石灰，将所得的熟石灰再加9升水即得10%石灰乳。
竹鼠粪便带血-直肠炎：成年鼠葡萄了每天0.5升左右，粗料投放要比平时次数要多，精料停放，并且注射氯霉素或者青霉素加流酸链霉素。竹鼠粪便鲜红：也有可能是在采食粗料时，被粗料刺伤导致，可和云南白药掺和面粉搓成条状喂服，期间粗料停喂。竹鼠肛门处带有血：有可能竹鼠发情后，竹鼠肛门处带有血，继而粪便上也会伴有血丝，这都属于正常现象。
竹鼠鼠池消毒液有：84消毒液、甲醛和高锰酸钾、百毒杀、聚维酮碘、毒克。不同类型的消毒液具有不同的使用方法和注意事项，建议在使用前仔细阅读产品说明书，并根据实际情况和养殖需求进行选择和使用。同时，还应注意消毒液的存储和使用安全，以免对人员和环境造成伤害。
竹鼠眼睛睁不开眼睛上有严重的黑色泪斑，眼屎分泌比较多，严重的眼睛会有脓性分泌物，有的甚至遮挡住整个眼睛，完全没法睁开；采食量基本正常，有的会有所下降，精神不是很好。全群竹鼠会在几天内陆续出现相同的病例，但传染性不明显，发病竹鼠多为2到5个月之间的青年鼠。
竹鼠拉稀粪便呈白色果冻状稀便这种情况是大肠杆菌感染，一般注射上海出的盐酸土霉素可以解决。
腹胀腹部胀，提鼠手接触腹部有明显的波浪感，大粪便有腥臭味，不成形，精神萎靡不振，脱水背躬，尾部毛湿漉，采食量下降，甚至不进食，之后腹泻不止，严重脱水。解剖可发现腹腔积水呈现白色透明胶状，肠道黏膜正常，肝脏，肺部无明显坏死灶。
1、被弃掉的幼竹鼠要寄养。2、产前补喂牛奶或者产前一个星期多喂多汁粗料防止产后无奶。3、冬天提前做好保暖措施，夏天做好降温措施。4、吃足初乳。5、母竹鼠疾病预防。